MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL01

Total Repeats: 1680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011758	TGC	2	6	343576	343581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_011758	GCCGT	2	10	343588	343597	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1503	NC_011758	TG	3	6	343605	343610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011758	GGCGC	2	10	343646	343655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1505	NC_011758	TGC	2	6	343665	343670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_011758	GGCC	2	8	343676	343683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_011758	GT	4	8	343715	343722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_011758	CG	3	6	343741	343746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_011758	GC	3	6	343756	343761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_011758	ACCT	2	8	343776	343783	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_011758	GAACC	2	10	343842	343851	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1512	NC_011758	GCC	2	6	343887	343892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_011758	GGC	2	6	343907	343912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_011758	CCGGA	2	10	343984	343993	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1515	NC_011758	ATC	2	6	344013	344018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_011758	GGC	2	6	344116	344121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_011758	CGC	2	6	344165	344170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_011758	ACAG	2	8	344191	344198	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_011758	GGC	2	6	344221	344226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_011758	CT	3	6	344276	344281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_011758	CGG	3	9	344355	344363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_011758	GCG	2	6	344390	344395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_011758	GAGCG	2	10	344452	344461	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1524	NC_011758	GC	3	6	344483	344488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_011758	CG	3	6	344496	344501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_011758	CGACG	2	10	344521	344530	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1527	NC_011758	CG	3	6	344598	344603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_011758	CG	3	6	344615	344620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_011758	ACG	2	6	344624	344629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_011758	CCG	2	6	344635	344640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_011758	CGCC	2	8	344663	344670	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1532	NC_011758	GAG	2	6	344701	344706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_011758	ACG	2	6	344717	344722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_011758	G	7	7	344794	344800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011758	CG	3	6	344815	344820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_011758	GCA	3	9	344834	344842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_011758	ACG	2	6	344843	344848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_011758	CGG	2	6	344850	344855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_011758	GCCG	2	8	344883	344890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_011758	AGCGCG	2	12	344891	344902	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_011758	ATG	2	6	344928	344933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_011758	CTTC	2	8	344949	344956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_011758	CGA	2	6	344967	344972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_011758	CG	3	6	344976	344981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_011758	GTTCG	2	10	345001	345010	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1546	NC_011758	GGCAT	2	10	345011	345020	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1547	NC_011758	GTT	2	6	345682	345687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_011758	ACG	2	6	345697	345702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_011758	TTATA	2	10	345714	345723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011758	TA	3	6	345731	345736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011758	CGC	2	6	345752	345757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_011758	GGC	2	6	345762	345767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_011758	GGC	3	9	345781	345789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_011758	GCGG	2	8	345879	345886	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_011758	CGG	2	6	346943	346948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_011758	CCG	2	6	346949	346954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_011758	GGGAT	2	10	346987	346996	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011758	GCC	2	6	347104	347109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_011758	GGC	2	6	348426	348431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_011758	CGGG	2	8	348457	348464	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_011758	GAG	2	6	348486	348491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_011758	CGA	2	6	349541	349546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_011758	CGGG	2	8	349552	349559	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_011758	GGC	2	6	349568	349573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_011758	TTG	2	6	349579	349584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011758	CCGGA	2	10	349677	349686	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1567	NC_011758	CCG	2	6	350094	350099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_011758	CG	3	6	350187	350192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_011758	CG	5	10	350195	350204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_011758	CGG	2	6	350208	350213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_011758	GAG	2	6	350241	350246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_011758	GCC	3	9	350296	350304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_011758	AGC	2	6	350305	350310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_011758	CCG	2	6	350320	350325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_011758	CGT	2	6	350334	350339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_011758	TCG	2	6	350398	350403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_011758	G	6	6	350405	350410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_011758	AC	3	6	352633	352638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_011758	GCC	3	9	352657	352665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_011758	GTC	2	6	357719	357724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_011758	CCG	2	6	357821	357826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_011758	TCG	2	6	357831	357836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_011758	CCG	2	6	357882	357887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_011758	G	6	6	357932	357937	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011758	CGAGC	2	10	357955	357964	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1586	NC_011758	GGC	2	6	357996	358001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_011758	CGC	2	6	358048	358053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_011758	GCG	2	6	358165	358170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_011758	CGG	2	6	358217	358222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_011758	GTC	2	6	358284	358289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_011758	CGG	2	6	358375	358380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_011758	CGA	2	6	358383	358388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_011758	TCC	2	6	360836	360841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_011758	GC	3	6	361910	361915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_011758	GCA	2	6	361934	361939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_011758	T	6	6	362008	362013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011758	TGA	2	6	362033	362038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_011758	TCC	2	6	362100	362105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_011758	GTC	2	6	362118	362123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_011758	GC	3	6	364791	364796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_011758	GCG	2	6	367343	367348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_011758	G	6	6	367348	367353	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_011758	GCCC	2	8	367358	367365	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1604	NC_011758	CAC	2	6	367474	367479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_011758	GAG	2	6	367487	367492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_011758	AAT	2	6	367496	367501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_011758	ACT	2	6	367566	367571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_011758	GAC	2	6	367650	367655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_011758	TC	3	6	368367	368372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_011758	CG	3	6	368413	368418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_011758	CGC	2	6	368434	368439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_011758	CAG	2	6	369550	369555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_011758	TGA	2	6	369570	369575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011758	GCC	2	6	369588	369593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_011758	C	6	6	369592	369597	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1616	NC_011758	TGA	2	6	369607	369612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_011758	ATT	2	6	369652	369657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_011758	GCA	2	6	371782	371787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_011758	GTC	2	6	371830	371835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_011758	CTT	2	6	371854	371859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_011758	GAC	2	6	374538	374543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_011758	ATT	2	6	374685	374690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_011758	TGC	2	6	374717	374722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_011758	CCT	2	6	374794	374799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_011758	TC	3	6	374819	374824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_011758	GAA	2	6	374855	374860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_011758	GAA	2	6	374912	374917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_011758	TCG	2	6	375000	375005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_011758	CAT	2	6	375021	375026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_011758	GACT	2	8	375939	375946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_011758	CG	3	6	376683	376688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_011758	GCCGGG	2	12	376700	376711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_011758	CG	3	6	376727	376732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_011758	ACG	2	6	376735	376740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_011758	GGA	3	9	376742	376750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_011758	GCA	2	6	376787	376792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_011758	CGA	2	6	376829	376834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1668	NC_011758	ATCA	2	8	377942	377949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1669	NC_011758	CG	4	8	377967	377974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1670	NC_011758	CGG	2	6	378034	378039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1671	NC_011758	GCGA	2	8	378075	378082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1672	NC_011758	CAGG	2	8	378095	378102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1673	NC_011758	AGG	2	6	378138	378143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1674	NC_011758	GCCGT	2	10	378208	378217	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1678	NC_011758	GGC	3	9	379753	379761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1679	NC_011758	TC	3	6	379767	379772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1680	NC_011758	GA	3	6	379795	379800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.